Mediante Decreto Nro. 589 del 8 de junio de 1905 se creó la Facultad de Matemáticas e Ingeniería con la Escuela de Ingenieros Civiles y en 1907 se creó la Revista de Ingeniería y como primer decano (rector) fue nombrado el Ingeniero Civil Fortunato Pereira Gamba.
Mediante Acuerdo No. 035 de 1983 emanado del Consejo Superior se crea la actual Facultad de Ingeniería, aunque tiene su historia desde 1971 por el convenio establecido con la Universidad del Cauca para ofrecer los programas de transferencia e intercambio en las carreras de Ingeniería Civil ofreciendo cuatro semestres para el programa de Civil en la Universidad de Nariño y seis terminales en la Universidad del Cauca, con titulación de ésta.
El Consejo Superior crea: el Programa Académico Ingeniería Civil mediante Acuerdo No. 035 de mayo 13 de 1983; el Programa Académico Ingeniería de Sistemas mediante Acuerdo 093 de 1993; el Programa Académico Ingeniería Electrónica mediante Acuerdo 062 de 2000.
La Facultad de Ingeniería en la actualidad cuenta con el Departamento de Ingeniería Civil que administra los programas académicos de pregrado: Ingeniería Civil en Pasto e Ingeniería Civil en Túquerres; Departamento de Sistemas que administra los programas académicos de pregrado: Ingeniería de Sistemas en Pasto, Ingeniería de Sistemas en Ipiales e Ingeniería de Sistemas en Tumaco; y el Departamento de Electrónica que administra el Programa Académico de Pregrado Ingeniería Electrónica en Pasto.
Los programas académicos: Ingeniería Civil, Ingeniería de Sistemas e Ingeniería Electrónica que se ofertan en la ciudad de Pasto, cuentan con Acreditación de Alta calidad expedida por el Ministerio de Educación Nacional.
La Facultad de Ingeniería oferta postgrados a nivel de especialización y maestría así: Especialización en Geotecnia y Especialización en Estructuras administradas por el Departamento de Ingeniería Civil. Especialización en Construcción de Software, Maestría en Gestión de Tecnologías de la Información y el Conocimiento y Maestría en Ingeniería de Sistemas y Computación administradas por el Departamento de Sistemas. Maestría en Ingeniería Electrónica administrada por el Departamento de Electrónica.
La Facultad de Ingeniería cuenta con los grupos de investigación: Grupo de Investigación en Riesgos, Amenazas y Medio Ambiente – GRAMA adscrito al Departamento de Ingeniería Civil. Grupo de Investigación Aplicada en Sistemas – GRIAS y Grupo de Investigación Galeras.NET adscritos al Departamento de Sistemas. Grupo de Investigación en Ingeniería Eléctrica y Electrónica – GIIEE adscrito al Departamento de Electrónica.
La Facultad de Ingeniería cuenta con los semilleros de investigación: Tecnopazifico, Green Clouds y Willa Muru adscritos al Departamento de Sistemas. Semillero de Investigación en Ingeniería Electrónica – SIIE adscrito al Departamento de Electrónica.
